冷萃酸奶应存放于低温环境中，建议在2-5℃的冰箱中保存，避免暴露在阳光下或高温环境中。打开后应及时饮用，未饮用的应装入密封容器中，避免受到空气、细菌、灰尘等污染。

如果长时间保存需要冷藏，可将其放置在冰箱的最低层，而且不应与未经处理的生鲜食品混存，以免交叉感染。同时应注意酸奶保质期，过期后的酸奶不应食用，以免对身体产生不良影响。