根据《道路运输安全法》规定，长途客车夜间行驶有严格的限制。在需要经过市区的情况下，长途客车应当在晚上10点至早上6点期间避免进入市区，以确保行车安全，减少交通事故的发生。

但在紧急情况下，如有病人、重大财产损失等特殊情况，长途客车可以获得警方许可进入市区行驶。因此，一般情况下，晚上2点后长途客车应当遵循指定路线行驶，避免进入市区，以保障公共交通秩序和旅客安全。