南丰并不是赣州以前的一部分。南丰的历史可以追溯到商周时代,当时已有人类繁衍生息。在春秋战国时期,南丰先后成为吴、越、楚的属地。秦始皇统一中国后,南丰被纳入九江郡。汉代时,南丰是南城县的一部分,隶属于豫章郡。
三国吴太平二年(257年),南丰正式设县,隶属于同年新设的临川郡。在随后的历史中,南丰的隶属关系有所变化,但境域没有发生大的变更。例如,西晋元康元年(291年),南丰从临川郡划归江州;南朝宋、齐、梁、陈时期,南丰都属于临川郡。唐景云二年(711年),南丰县复置,隶属于江南道。在宋朝,南丰属建昌军,元朝至元十九年(1282年)升为南丰州,直隶江西行中书省。明朝洪武三年(1370年),南丰州降为县,仍属建昌府。
近代以来,南丰在行政上也有所变动。例如,在第二次国内革命战争时期,南丰曾是革命根据地的一部分。1949年8月17日南丰解放后,归抚州地区管辖,直到2000年抚州撤地设市,南丰成为抚州市的一部分。