是的，在昆山市有娃哈哈的工厂。昆山作为江苏省的一个重要工业城市，吸引了许多国内外知名企业的投资与落户。娃哈哈作为中国著名的食品制造企业之一，也在昆山投资建设了工厂。该工厂采用先进的生产设备和技术，致力于生产高品质、健康的食品产品，为广大消费者提供优质的服务。娃哈哈的昆山工厂也为当地经济的发展和就业的增加做出了贡献。