移动卫生间的粪便处理需要格外注意卫生和环境保护。首先需要将粪便收集装置和移动卫生间本身定期清洁消毒，避免产生异味和细菌滋生。

其次，在粪便处理方面，可以将其集中收集后，送至指定污泥处理厂进行处理。同时，在挑选移动卫生间时，需要选择环保、可降解的材料制作而成，以减少对环境的影响。最后，注意教育使用者避免乱扔乱倒造成环境污染。