可以选择使用拼箱运输。

因为39箱货物量较小，不足以租用一整个集装箱进行运输，但使用拼箱运输可以将多个小批次货物整合为一起运输，既能节约成本又能保证货物安全。

此外，也可以考虑采用陆运和空运等多种交通方式进行组合运输，以达到更加经济、高效的运输效果。