蛋白棉是一种弱碱性阴离子交换树脂，主要用于吸附水中的杂质，特别是在化工行业处理污水和水族馆鱼缸的清理过滤中较为常见。它具有再生效率高、碱水耗低、交换容量大、抗有机物污染及抗氧化能力强、机械强度高等优点。然而，蛋白棉长期放在滤材里使用可能会存在一些问题。

首先，蛋白棉在吸附水中的杂质的同时，可能会将水中的酸分子也吸附，这可能导致水体的PH值发生改变。因此，在使用蛋白棉进行净水时，需要特别注意水质酸碱度的变化。

其次，蛋白棉在长期使用后，尤其是在吸收杂质达到饱和后，不仅不会继续吸收杂质，还可能因为吸附的杂物而造成堵塞，特别是在网眼细小的进水口或前置桶等地方。这种堵塞可能会影响水流的畅通，甚至影响整个过滤系统的运行。

此外，蛋白棉在使用后是可以重复使用的，但需要注意，它不能露天放置，因为风干后可能会影响其使用效果。

因此，虽然蛋白棉在过滤系统中具有一定的应用价值，但不建议长期放在滤材里使用。在实际应用中，应根据具体情况定期更换或清理蛋白棉，以确保其有效性和过滤系统的正常运行。同时，也应注意观察水质变化，及时调整和处理。