黄曲霉毒素主要存在于发霉的谷类中，比如玉米、小麦、大麦、燕麦、大米等。另外霉变的花生、大豆，也较常出现黄曲霉毒素。发霉的坚果、棉籽、植物油以及肉制品中也可能含有黄曲霉毒素。黄曲霉毒素是由黄曲霉以及寄生曲霉等生成的代谢产物，如果粮食或饲料没有及时地晒干，或储存不当，比如保存在潮湿环境中、开封后未予以密封等，则较容易出现黄曲霉、寄生曲霉，从而产生此类毒素。