自来水除氯后仍然会有水垢。水垢是由水中溶解的钙、镁等金属离子和碳酸根离子反应形成的，与氯无关。虽然去除氯能减少水垢的形成，但不能完全消除。在长期使用自来水的过程中，仍然会有一定程度的水垢积累。因此，需要定期使用除垢剂进行清洗，以保证水质的干净、健康。