小米空调M1A1和M3A1的主要区别体现在功率、适用面积以及性能上。

M1A1通常属于1.5匹的空调，适合中小型房间使用，其制冷和制热效果都非常理想，能够满足大多数家庭的需求。而M3A1的功率可能更大，适用于更大的空间。

在性能上，两者可能都采用了变频技术，能够根据室内外环境的变化智能调节制冷和制暖效果，让室内温度更加稳定和舒适。但具体的技术细节和性能参数可能有所不同，可以根据官方提供的数据进行对比。

总的来说，选择哪一款空调需要根据自己的实际需求和预算来决定。建议到小米官网或实体店详细了解两款空调的详细参数和用户评价，以便做出更明智的选择。