原告撤诉的案件档案会被留存。法院在立案受理案件后，会为每个案件分配一个案件编号。无论是判决、调解还是撤诉，案件都会形成卷宗进行存档。这些存档的案件信息可以通过身份证和案号查询，也可以委托律师查询。目前，法院的档案存档已经从纸质转向电子，使得查询和保存案件档案更加便利和有保障