是的，船员健康证一般分为以下两种：

1. 甲板部健康证，适用于从事甲板部门的船员。

2. 餐饮部健康证，适用于从事餐饮部门的船员。

不同船舶类型和船舶排班情况等因素也会影响到船员的健康证申领类型。具体申领流程和标准，建议船员向船方的管理部门咨询。