公寓学区房和住宅学区房在多个方面存在明显的区别。

首先，从房屋使用定位来看，公寓通常是商业用房，具有商住两用的特点。这意味着公寓不仅可以作为居住用途，还可以作为办公或出租等商业用途。而住宅则是专为长期居住而设计的，其设计、构造特点更适合家庭生活。

其次，产权年限方面，公寓作为商业用地，其产权年限通常只有40年。扣除开发商的规划、建造等时间后，业主实际能够使用的年限可能更短。而住宅的土地使用权一般是50到70年，并且到期后可以免费申请继续使用。

再来看学区房的特点，学区房是由教育部门根据片区入学生源划分的，位于特定学区范围内的房产。这样的房产意味着学生可以享受义务教育免试就近入学的权益。无论是公寓还是住宅，只要位于学区内，都可以被称为学区房。

但具体到公寓学区房和住宅学区房，两者在居住环境和舒适度上可能有所不同。由于公寓的商住两用特性，其居住环境可能不如住宅纯粹和舒适。而住宅则更注重居住体验，提供更适宜家庭生活的环境。

此外，两者在价格上也可能存在差异。一般来说，住宅学区房的价格可能会高于公寓学区房，因为其更长的产权年限和更优越的居住条件通常会使其更具投资价值。

综上所述，公寓学区房和住宅学区房在房屋使用定位、产权年限、居住环境和价格等方面都存在区别。购房者在选择时，应根据自身需求和预算进行权衡。