青砧是指嫁接苗的砧木，通常用来提高抗病性、适应性和产量。而自根砧是指植物自身根系直接生长，不经过嫁接。

这两者的主要区别在于青砧经过嫁接，具有更多的抗性和适应性优势，而自根砧则保持了植物原有的根系特性，更自然但可能抗性较低。