申请乡村扶贫集装箱可以通过向当地政府或扶贫办申请。首先需要填写相关申请表格并提供必要的材料和证明，例如家庭收入证明、贫困户证明等。政府或扶贫办会对申请人的情况进行审核，并根据实际情况拨配集装箱。

申请者还需要签署相关协议并承诺使用集装箱开展产业或经营活动，以实现自身脱贫致富的目标。