商业贷款和公积金贷款的利率不同，以及还款方式也不尽相同，因此会对还款总额有所影响。

假设商贷和公积金贷款利率分别为5%和3.25%，还款方式为等额本金，那么商贷十万三十年的还款总额为14.8万元左右，而公积金贷款十万三十年的还款总额为12.3万元左右，两者相差约2.5万元。但是需要注意的是，具体还款总额会受到一些其它因素影响，比如首付款比例、还款方式等。