新星红苹果纪念和普通红苹果在品种上存在差异。

因为新星红苹果纪念是由中国苹果研究院选育，并且经过多次优化和改良，具有更高的产量和更好的品质，口感更加甜脆爽口，同时又具有亮度高、果形美、色泽艳的特点。

而普通红苹果则是由其他苹果品种选育而来，其品质和产量均低于新星红苹果纪念。

此外，新星红苹果纪念还被广泛应用于衍生产品开发和农业科技创新领域，具有更广阔的应用前景和经济价值。

因此，新星红苹果纪念和普通红苹果在品种、品质和应用方面存在差异，是更值得种植和推广的苹果品种之一。