阿里巴巴菜鸟总部是负责物流配送的。

因为阿里巴巴公司是电商业务的领军者，拥有众多的线上商家，所以为了解决商品的物流配送问题，阿里巴巴成立了菜鸟网络，在国内建立了一整套的电商物流配送体系，通过建立分布式智能物流网络，加强信息技术的应用，从而实现了高效、低成本的物流配送服务。

同时，菜鸟网络也提供了一整套物流解决方案，如条码技术、云计算、物联网等，为各行业提供物流配送服务，使物流成为电商行业的基础设施和核心竞争力。