保障性住房的房产证和普通住房的房产证有一些不同。

首先，保障性住房的房产证上会明确标明其属于政府或社会机构管理的保障性住房，而普通住房则没有这一标识。

其次，保障性住房的房产证上也会明确标明其所属的公共租赁住房或人才公寓等类型，以及相关的管理规定和房租政策。

此外，保障性住房的房产证一般会注明其购买或租赁的条件和期限，以及相关的产权归属和转让规定。总之，保障性住房的房产证是一份特殊的产权证明文件，其与普通住房的房产证在信息内容和管理规定上存在一定的差异。