不合并原因是上海交通大学和西安交通大学作为两所历史悠久、声誉卓著的高等学府，各自拥有独特的办学理念、学科特色和校园文化，合并可能会破坏两校的传统和独立性。

此外，上海交通大学和西安交通大学在各自的地域和学科领域都有较强的影响力，合并后可能会导致管理混乱、资源浪费等问题。

虽然上海交通大学和西安交通大学没有合并，但可以通过加强合作与交流，共同推动学术研究、人才培养等方面的发展，实现优势互补，共同提升办学水平。