清理母甲鱼时，首先确保其已死亡并处于安全状态。用刷子轻轻刷洗甲鱼的外壳，去除泥沙和污垢。接着，用刀割开腹部，清除内脏和消化物。注意要小心处理，避免割伤自己。然后，用流动水冲洗干净甲鱼内部的残留物。最后，用干净的布或纸巾擦干甲鱼的外壳和内部，准备烹饪。

在清理过程中，务必保持卫生，避免交叉污染。清理完毕后，请确保将所有工具和手部彻底清洗干净。