柯尔克孜语属阿勒泰语系突厥语族，有皆盖、特斯开两种方言。词汇的多源性是柯尔克孜语的一个特点。皆盖方言是柯尔克孜族现代书面标准语和文学语言的基础。

皆盖方言因受哈萨克语影响，畜牧业词汇较丰富，有较多的哈萨克语借词及柯尔克孜语与哈萨克语结合而成的词汇和土语。居住在克孜勒苏柯尔克孜自治州的柯尔克孜族大都使用本民族语言。