吉林省通化市五所医院在社保试点时缴纳的社保是按照以下方式处理的：吉林省通化市五所医院在社保试点时缴纳的社保是根据相关政策和规定进行处理的。

在社保试点期间，吉林省通化市五所医院按照国家和地方政策的要求，将员工的社保缴纳工作进行了规范和操作。

具体的处理方式可能包括但不限于：将缴纳的社保费用按照规定的比例划拨给社保机构，确保员工的社保权益得到保障。

社保试点是为了探索和完善社会保障制度，提高社会保障水平和覆盖范围。

吉林省通化市五所医院参与社保试点是为了积极响应国家政策，推动社会保障制度的改革和发展。

通过缴纳社保，员工可以享受到医疗、养老、失业等方面的保障，提高生活质量和安全感。

同时，社保试点也有助于优化医疗资源配置，提高医疗服务质量和效率。