工业总产值计算中使用月平均单价和年平均单价会产生一定的差异，这是因为这两种单价计算方法所考虑的时间跨度不同。

月平均单价是指某个月份内某种产品的销售总额除以该月份销售的产品数量，反映的是该月份内产品的平均价格。

年平均单价是指某一年内某种产品的销售总额除以该年销售的产品数量，反映的是该年产品的平均价格。

由于价格波动、市场需求和竞争等因素，同一种产品在不同时间段内的价格可能存在较大差异。因此，在计算工业总产值时，使用月平均单价和年平均单价都有其适用的情况。

如果产品的价格波动较大或者市场竞争较为激烈，使用月平均单价可以更准确地反映该产品在该月份内的市场表现。如果产品的价格变化较为平稳，使用年平均单价可以更准确地反映该产品在整个年度内的市场表现。

综上所述，选择使用月平均单价还是年平均单价应该根据具体情况进行决策，以尽可能准确地反映产品的市场表现和工业总产值。