需要通过交通管理部门的官网或者手机APP进行违章查询和扣除相应的违章分数。

具体操作流程为：明确结论是需要通过官网或APP进行违章查询和扣分操作；解释原因是因为过去需要前往交通管理部门的现场窗口进行操作，十分繁琐，使用官网或手机APP方便快捷；内容延伸是，扣分并不仅仅是直接在驾驶证上扣除相应分数，根据中国道路交通安全法规定，被扣除12分的驾驶员将面临吊销驾驶证的风险，因此行车时需严格遵守交通规则，不违反法律法规。