自建房沉降承重柱裂缝的主要原因可能是设计或施工时没有考虑到地基承载力不足或者不均匀，导致建筑物出现不均衡的沉降，进而导致承重柱受到不均匀的压力。

同时，承重柱本身的材料和结构也会对裂缝的产生起到影响。如果承重柱的尺寸小或者材质不合适，或者施工时没有按照规范进行加固，也可能导致裂缝的产生。因此，在自建房的过程中一定要注重设计和施工的质量，以确保建筑物的安全和稳定。