萨摩耶犬的两只眼睛颜色不一样是一种常见的遗传现象，被称为异色眼。这种情况通常发生在白色萨摩耶身上，其中一只眼睛是褐色或棕色的，而另一只眼睛可能是蓝色、灰色、绿色或金色等颜色。

异色眼是由于一种基因突变引起的，这种突变会导致某些细胞中的黑色素产生减少或消失，从而使得眼睛中的虹膜颜色不同。这种基因突变并不影响狗狗的视力和健康，而且还增加了它们迷人的外貌特征。

需要注意的是，如果萨摩耶犬出现了其他异常情况，如视力问题、眼部感染等，则应该及时就医治疗。