取消证券的第三方存管的办法一般是：

1. 从证券公司处向银行发出书面指示，说明取消第三方存管；

2. 银行收到指示后，根据指示对现有证券账户进行关闭；

3. 证券公司会在完成关闭后，向客户发出确认函；

4. 客户在收到确认函后，转账至证券账户，以完成取消第三方存管的手续；

5. 第三方存管账户将会被立即取消。