自发绿豆芽会发红是因为豆苗内的成分发生了氧化作用，以及发豆苗时，受到光照和水分不足，而产生了花青素和叶绿素等。

因此，绿豆芽若只是颜色变红，是不影响后期食用的。若想避免绿豆芽的豆瓣变红，在制作或保存时，要注意避光和保湿，可以用深色的布遮挡阳光。