合同上标明三个月之后才可以离职是合法的。

根据劳动法规定，雇佣关系是双方自愿建立的，双方在签订劳动合同时可以约定离职的期限。

合同上规定三个月之后才可以离职，是为了保障雇主的合理利益，确保员工在离职前有足够的时间完成交接工作，避免对企业造成不必要的损失。

同时，这也给员工提供了稳定的工作环境和收入来源。

需要注意的是，合同规定的离职期限应当符合法律法规的规定，不能违反劳动法的相关规定。