博物馆一般不会建在水下。

根据我们对世界各地的博物馆研究发现，博物馆一般都是建造在地面上或者高层建筑中，这样可以更好地展示和保护文物和艺术品。

当然，也有一些文化遗址或者海洋动植物保护中心等特定场所会建造在水下，这与博物馆的设立目的和定位并不相同。

同时，水下建筑的建造和运营也需要考虑到更多的技术和安全要素，难度比较大。

因此，在一般情况下，博物馆并不会建在水下。