不能办确权证。

因为农村土地的确权工作是从2008年开始实施的，之前的窑洞属于自然村和集体经济组织的土地，还未进行确权登记。

而现在的确权工作也有时间范围，只有符合条件的自然人、法人或组织才能办理确权证。

因此，农转非86年前的窑洞不能办理确权证。