在中国，工伤保险和医疗保险是两个不同的保险体系。工伤保险主要用于赔偿因工作导致的受伤或疾病，而医疗保险则用于赔偿就医产生的医疗费用。

如果您因工伤去医院看病，并使用医保卡结算自费部分，一般来说不会有太大的影响。工伤保险通常会涵盖医疗费用，但具体情况可能因您的工伤险投保方案和当地政策而有所不同。建议您在就医前咨询单位或保险公司，了解您的工伤保险具体涵盖哪些费用。

需要注意的是，如果您的工伤已经认定为工伤，并已经按照规定进行了工伤报告和认定，那么您应该按照工伤保险程序寻求赔偿，而不是使用医疗保险进行结算。如果您使用医疗保险结算，可能会影响您日后申请工伤赔偿。因此，在使用医保卡结算自费部分时，请务必谨慎行事，并确保您了解您的保险范围和政策。