边牧幼犬常见的毛色有黑白两色、蓝白两色和棕白两色，此外还有以黑、蓝、棕为主色的三色毛，以及蓝陨色和红陨色等。大部分人认为边牧只有黑白两色，只是因为这种颜色最常见。世界几大犬业协会，只有澳大利亚比较特殊，只允许黑/白、蓝/白、巧克力/白、红/白、蓝陨石、黑白三色（黑/棕/白），且所有颜色中白色不能是主要颜色。

其他协会（FCI、AKC、KC）基本一致：任何颜色都是允许的，但白色不能占主要地位。