皮脂腺囊肿手术在门诊进行时，一般来说，医保是不报销的。但是，如果选择了住院治疗，那么手术费用就可以通过医保报销。具体的报销比例会根据不同的医保类型（如职工医保、新农合等）有所不同。比如，职工医保的报销比例大约为85%，而新农合的报销比例大约为55%。但请注意，以上信息仅供参考，具体还需根据当地医保政策和具体情况来确定。