毛巾a类和3a抗菌的区别是抗菌效果不同。毛巾的抗菌效果可以从毛巾的抗菌级别中看出，国家标准为A级，AA级，AAA级，A级别越高，抗菌效果越好。毛巾3a抗菌比毛巾a类抗菌在抗菌A级别上高两个档次，所以毛巾3a类与a类的区别就在于抗菌效果的不同。