要在文件上使用红色笔标注，可以选择以下两种方式：

第一种是直接使用红色笔或红色圆珠笔对文件进行标注；

第二种是将文件复制到电子文档中，然后使用电子标记工具在需要标注的地方使用红色标记。使用红色标记可以突出需要重点关注的内容，让读者更加易于理解和注意到。同时，应该确保标注清晰、不影响文件阅读。在进行标注时，需要认真分析文件内容并结合具体情境决定标注内容及程度。