永昌臭豆腐的正宗做法一般包括以下几步：先用黄豆泡水发酵，之后煮熟，待凉后加入少量面粉搅拌成糊状，放入容器中发酵，一般需要3-4天。

发酵后将豆腐切成不规则形状，再在表面刷上特制的调料，放到密闭的罐子里进行二次发酵，大概需要1-2天，直到出现臭味为止。最后，将臭豆腐油炸或蒸熟即可。注意，永昌臭豆腐的特色在于选用的发酵、调料等都有独特秘方，因此在家制作难以完全达到正宗口感。