三层别墅门的高度最佳应根据建筑设计和实际需求而定，一般建议门高度不低于2.4米，以保证人能够自由进出房屋，并为家具和大件物品进出留下充足空间。

另外，考虑到美观和视野，门框高度可适度增加至2.7米左右。当然，也要考虑到居住需求和安全因素，如有老人或儿童居住，门的高度需要适当降低，并安装合适的扶手或门禁系统来保障家人的安全。总之，三层别墅门高度的选择需要全方位的考虑，以满足家庭的实际需求和安全要求。