高三下学期在家自学是否有毕业证，这主要取决于你所在学校的具体规定和政策。一般而言，只要你满足学校的毕业要求，如完成规定的课程学习、通过各种考试等，无论你是在学校学习还是在家自学，都是有资格获得毕业证的。

然而，在家自学需要很强的自律性和自我管理能力，因为缺乏老师的指导和课堂上的互动，可能会影响到你的学习效果。此外，你还需要确保自己能够按照学校的要求完成各种任务和考试。

因此，如果你打算在家自学，建议提前与学校沟通，了解具体的规定和要求，确保自己能够按照要求完成学业，从而顺利获得毕业证。