是的，巫师3的武器在附魔后仍然可以插入石头。附魔可以为武器增加一些额外的属性或特殊技能，而插入石头则可以提高武器的整体性能，比如攻击力、持久度等。因此，在巫师3中，附魔和插石头是可以同时使用的，且不会互相干扰。玩家可以根据自己的需要和游戏进度来选择合适的武器附魔和石头插入，以提高自己的战斗能力。