根据猫科动物的本能行为，三个月的小猫已经会开始独立生活。离开猫妈妈后，虽然可能会有适应期和一些不适应的情况，但它们大概率会保留对猫妈妈的记忆和认知。

当再次见面时，小猫可能会表现出兴奋和亲密的行为，例如舔毛、嗅闻、摩擦等，表现出对熟悉的亲人和环境的熟悉和渴望。但具体的认知程度还需要视小猫个体的自然反应和环境变化而定。