工商银行经营组合贷当天扣款次数取决于贷款合同的具体约定。一般情况下，当天扣款一次，用于支付贷款利息。但如果贷款合同约定当天扣款两笔，分别为付息和还本，则当天扣款两次。具体扣款次数和金额以贷款合同为准。