暗反应是光合作用的关键步骤之一，它发生在光合体内膜系统中，将二氧化碳转化为有机物质。

首先，酶羧化酶催化RuBP结合二氧化碳生成稳定的6碳分子，接着，该分子必须被分解成3碳结构，通过环己糖磷酸途径反复转化成两个甘油醛3磷酸分子，最后，这些甘油醛3磷酸经过酶的作用生成葡萄糖和有机化合物。整个过程需要ATP和NADPH的供应。