住院期间做磁共振和CT检查是可以报销的，但具体报销比例和范围可能因地区和医疗保险政策而有所不同。一般来说，住院辅助检查包括心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费，这些费用中有些是可以报销的，有些则不能。

具体来说，CT和磁共振这类检查属于住院辅助检查，在医保范围内，可以按照规定的比例进行报销。但是，不同地区的医保政策和报销比例可能存在差异，因此需要参保人咨询当地的社保局或者医保办，以了解具体的报销比例和范围。

此外，需要注意的是，医保报销的范围和比例可能会随着政策的调整而发生变化，因此需要参保人随时关注医保政策的变化，以便及时了解最新的报销情况。