侵占两亩土以上的处理方式为追究民事责任并进行土地征收。

因为土地是国家所有的资源，只有按照规定的流程和程序进行土地使用和征收，才能维护土地资源的合法权益。

如果有个人或单位因为各种原因侵占了两亩土以上，就需要依法追究民事责任，并进行土地征收。

在土地征收的过程中，需要填写相应的申请表和提交相关的申请材料，由当地政府对土地进行评估和估价，并进行合理的补偿。

土地征收后，土地的管理和使用权将归政府所有，根据相应的规定进行统一的规划、配置和利用。