金蝶KIS专业版进行盘存的操作步骤如下：

首先，在主界面中点击“库存管理”，然后选择“盘存管理”，接着选择需要进行盘存的仓库，在盘存单界面中点击“新增”，填写盘存单信息，包括盘存日期、盘存人员等，然后点击“确定”保存，进入盘存单详情界面，点击“新增”开始进行盘存，输入物料编码、数量等信息，点击“保存”即可完成盘存。最后，点击“提交”审核盘存单并生成盘点报告。