广佛肇轻轨不能直达广州站的原因主要是因为广州站已经是一个高铁站，而高铁与轻轨的技术标准与线路规划是不同的。广佛肇轻轨是一条城市轨道交通，以城市出行为主要服务对象，与高铁站的作用和服务对象不同，因此建造轻轨时并没有考虑到连接到广州站的需要。此外，广州站周边也已经有地铁等多种交通方式，使得轻轨连接广州站的必要性相对较小。