1、如果农村自建房超平，则需要进行合法化处理才能办理房产证。

2、农村自建房属于违章建筑，需要进行合法化处理，包括申请规划建设、竣工验收等手续。

3、如果房屋符合规划建设标准，经过竣工验收，并且在土地使用权、房屋所有权等方面的手续齐备，就可以办理房产证了。

4、需要注意的是，如果房屋不符合规划建设标准或者土地使用权、房屋所有权等方面的手续不齐备，就无法办理房产证。

此时，需要根据实际情况进行合法化处理。